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北林等完成世界首张梅花全基因组变异图谱

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来源: 作者: 2019-05-17 02:12:05

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北京林业大学教授张启翔领衔的国家花卉工程技术研究中心与青岛华大基因研究院、深圳华大生命科学研究院及美国宾夕法尼亚州立大学等单位合作,完成了首个梅花全基因组重测序研究,构建了世界首张梅花全基因组变异图谱。该成果对梅花重要观赏性状的遗传解析具有里程碑的作用。既为其分子标记辅助育种研究提供了重要的理论框架,又为重要观赏性状基因的遗传选育及品种改良提供了重要平台。相关研究论文日前在《自然—通讯》发表。

我国是世界上重要的梅花起源和栽培中心,已有3000多年栽培历史。梅花栽培品种经长时间人工驯化和自然授粉,其遗传背景极其复杂。

为揭示梅花演变历史,研究人员开展了梅花分子标记辅助育种工作,力图揭示梅花重要观赏性状的遗传机理。该项目选取333株梅花品种、15株野生梅花和梅花的近缘物种山杏、山桃和李,展开全基因组重测序研究,极大推动了梅花群体遗传学分析、全基因组关联分析。

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p>研究者以梅花的近缘物种山杏、山桃和李为外类群,构建了梅花品种的系统发育树,从16个亚群中选择7个梅花品种、1个野生梅花,与山杏、山桃、李进行深度测序和基因组组装,结合已经发表的桃和梅花基因组,开展梅花和李属的泛基因组学研究,得出了一系列重要结论。

研究人员对333株梅花品种的24个重要观赏性状进行了全基因组关联分析,在梅花的4条染色体上分别鉴定了5个显著的候选基因区域与花色、花萼色彩、柱头颜色、花药颜色、花瓣数、花径、木质部色彩和株型等10个性状。该研究结果为揭示梅花花色的分子遗传机理奠定了基础。(铁铮)

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